Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Trak1Q6PD31 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trak1Q6PD31 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trak1Q6PD31 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms