Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RgmaQ6PCX7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RgmaQ6PCX7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms