Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp49Q6P9L4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp49Q6P9L4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp49Q6P9L4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms