Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp2d40Q6P8N9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp2d40Q6P8N9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms