Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc189Q6NZQ0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc189Q6NZQ0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms