Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asic1Q6NXK8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Asic1Q6NXK8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asic1Q6NXK8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms