Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Colgalt2Q6NVG7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Colgalt2Q6NVG7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Colgalt2Q6NVG7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms