Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Pdcd11Q6NS46 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Pdcd11Q6NS46 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms