Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nckap5lQ6GQX2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nckap5lQ6GQX2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms