Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg9bQ6EBV9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg9bQ6EBV9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg9bQ6EBV9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms