Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx11Q6AXC6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx11Q6AXC6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms