Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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Cep290Q6A078 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Cep290Q6A078 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Cep290Q6A078 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Cep290Q6A078 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cep290Q6A078 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Cep290Q6A078 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep290Q6A078 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Cep290Q6A078 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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