Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Swap70Q6A028 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Swap70Q6A028 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swap70Q6A028 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swap70Q6A028 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swap70Q6A028 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swap70Q6A028 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swap70Q6A028 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Swap70Q6A028 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swap70Q6A028 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swap70Q6A028 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swap70Q6A028 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swap70Q6A028 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swap70Q6A028 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swap70Q6A028 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Swap70Q6A028 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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