Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Jmjd1cQ69ZK6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Jmjd1cQ69ZK6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms