Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CltcQ68FD5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CltcQ68FD5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CltcQ68FD5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CltcQ68FD5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CltcQ68FD5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms