Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sbno1Q689Z5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sbno1Q689Z5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sbno1Q689Z5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms