Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PatjQ63ZW7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PatjQ63ZW7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PatjQ63ZW7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms