Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Itga3Q62470 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms