Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nptx1Q62443 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nptx1Q62443 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms