Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl12Q62401 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl12Q62401 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms