Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpd52Q62393 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpd52Q62393 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpd52Q62393 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms