Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Sall3Q62255 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sall3Q62255 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sall3Q62255 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms