Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox19Q62249 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox19Q62249 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms