Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprrQ62132 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PtprrQ62132 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms