Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkd1Q62101 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prkd1Q62101 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms