Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt33bQ61897 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33bQ61897 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33bQ61897 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 528.3 ms