Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifi47Q61635 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ifi47Q61635 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms