Protein–RNA interactions for Protein: Q61206

Pafah1b2, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b2Q61206 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pafah1b2Q61206 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pafah1b2Q61206 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms