Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prpf4bQ61136 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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