Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp4Q61107 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp4Q61107 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp4Q61107 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp4Q61107 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp4Q61107 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp4Q61107 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp4Q61107 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp4Q61107 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp4Q61107 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp4Q61107 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp4Q61107 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp4Q61107 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gbp4Q61107 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp4Q61107 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp4Q61107 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gbp4Q61107 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4Q61107 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4Q61107 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4Q61107 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4Q61107 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4Q61107 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4Q61107 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gbp4Q61107 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms