Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxf1Q61080 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxf1Q61080 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms