Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf3Q60980 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf3Q60980 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms