Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp4Q60972 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp4Q60972 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms