Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grik1Q60934 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Grik1Q60934 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Grik1Q60934 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms