Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Neurod1Q60867 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Neurod1Q60867 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Neurod1Q60867 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms