Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epha1Q60750 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha1Q60750 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms