Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Samhd1Q60710 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samhd1Q60710 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms