Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Scaf1Q5U4C3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scaf1Q5U4C3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scaf1Q5U4C3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.5 ms