Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brip1Q5SXJ3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brip1Q5SXJ3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brip1Q5SXJ3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms