Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc42Q5SV66 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc42Q5SV66 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc42Q5SV66 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms