Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bbs12Q5SUD9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbs12Q5SUD9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms