Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Utp18Q5SSI6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Utp18Q5SSI6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms