Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmprss11eQ5S248 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmprss11eQ5S248 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmprss11eQ5S248 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms