Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d4Q5RJF7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d4Q5RJF7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d4Q5RJF7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d4Q5RJF7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna2d4Q5RJF7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d4Q5RJF7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d4Q5RJF7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d4Q5RJF7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d4Q5RJF7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d4Q5RJF7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d4Q5RJF7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d4Q5RJF7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna2d4Q5RJF7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna2d4Q5RJF7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d4Q5RJF7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms