Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nsrp1Q5NCR9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nsrp1Q5NCR9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms