Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rapgef6Q5NCJ1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Rapgef6Q5NCJ1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms