Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l3Q5ISE2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36l3Q5ISE2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms