Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trpm3Q5F4S9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trpm3Q5F4S9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
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