Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
L1td1Q587J6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
L1td1Q587J6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1td1Q587J6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1td1Q587J6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1td1Q587J6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1td1Q587J6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1td1Q587J6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1td1Q587J6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1td1Q587J6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1td1Q587J6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1td1Q587J6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1td1Q587J6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1td1Q587J6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1td1Q587J6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1td1Q587J6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1td1Q587J6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms