Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Znf608Q56A10 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Znf608Q56A10 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Znf608Q56A10 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Znf608Q56A10 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Znf608Q56A10 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Znf608Q56A10 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Znf608Q56A10 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Znf608Q56A10 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Znf608Q56A10 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms